Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CatspereP0DP43 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CatspereP0DP43 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CatspereP0DP43 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CatspereP0DP43 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CatspereP0DP43 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms