Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Igsf6P0C6B7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igsf6P0C6B7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms