Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa9P09631 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxa9P09631 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxa9P09631 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa9P09631 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa9P09631 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa9P09631 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa9P09631 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa9P09631 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa9P09631 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa9P09631 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa9P09631 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa9P09631 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa9P09631 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxa9P09631 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa9P09631 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa9P09631 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa9P09631 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa9P09631 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxa9P09631 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms