Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxb7P09024 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxb7P09024 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxb7P09024 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxb7P09024 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxb7P09024 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxb7P09024 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxb7P09024 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxb7P09024 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxb7P09024 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxb7P09024 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxb7P09024 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxb7P09024 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxb7P09024 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxb7P09024 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxb7P09024 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxb7P09024 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxb7P09024 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxb7P09024 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxb7P09024 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxb7P09024 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxb7P09024 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxb7P09024 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxb7P09024 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Hoxb7P09024 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hoxb7P09024 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms