Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NefmP08553 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NefmP08553 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NefmP08553 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NefmP08553 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NefmP08553 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NefmP08553 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NefmP08553 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NefmP08553 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NefmP08553 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NefmP08553 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NefmP08553 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NefmP08553 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NefmP08553 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NefmP08553 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NefmP08553 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NefmP08553 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NefmP08553 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NefmP08553 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NefmP08553 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NefmP08553 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NefmP08553 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NefmP08553 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NefmP08553 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NefmP08553 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NefmP08553 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NefmP08553 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NefmP08553 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NefmP08553 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NefmP08553 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NefmP08553 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NefmP08553 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NefmP08553 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NefmP08553 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NefmP08553 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NefmP08553 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NefmP08553 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NefmP08553 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NefmP08553 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NefmP08553 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NefmP08553 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NefmP08553 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NefmP08553 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NefmP08553 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NefmP08553 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NefmP08553 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NefmP08553 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NefmP08553 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NefmP08553 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NefmP08553 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NefmP08553 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NefmP08553 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NefmP08553 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NefmP08553 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NefmP08553 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NefmP08553 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NefmP08553 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NefmP08553 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NefmP08553 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NefmP08553 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NefmP08553 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NefmP08553 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NefmP08553 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NefmP08553 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NefmP08553 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NefmP08553 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NefmP08553 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NefmP08553 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NefmP08553 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NefmP08553 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NefmP08553 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NefmP08553 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NefmP08553 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NefmP08553 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NefmP08553 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NefmP08553 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NefmP08553 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NefmP08553 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NefmP08553 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NefmP08553 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NefmP08553 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NefmP08553 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NefmP08553 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NefmP08553 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NefmP08553 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NefmP08553 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NefmP08553 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NefmP08553 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NefmP08553 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NefmP08553 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NefmP08553 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NefmP08553 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NefmP08553 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NefmP08553 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NefmP08553 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NefmP08553 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NefmP08553 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NefmP08553 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NefmP08553 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NefmP08553 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms