Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Col3a1P08121 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col3a1P08121 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col3a1P08121 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms