Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Spta1P08032 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Spta1P08032 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spta1P08032 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spta1P08032 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spta1P08032 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spta1P08032 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Spta1P08032 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spta1P08032 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spta1P08032 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spta1P08032 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Spta1P08032 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms