Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Me1P06801 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Me1P06801 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Me1P06801 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Me1P06801 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Me1P06801 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Me1P06801 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Me1P06801 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Me1P06801 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Me1P06801 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Me1P06801 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Me1P06801 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Me1P06801 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Me1P06801 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Me1P06801 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Me1P06801 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Me1P06801 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Me1P06801 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Me1P06801 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Me1P06801 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Me1P06801 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Me1P06801 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Me1P06801 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Me1P06801 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Me1P06801 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Me1P06801 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Me1P06801 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Me1P06801 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Me1P06801 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Me1P06801 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Me1P06801 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Me1P06801 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Me1P06801 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Me1P06801 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Me1P06801 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Me1P06801 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Me1P06801 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Me1P06801 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Me1P06801 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Me1P06801 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Me1P06801 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Me1P06801 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Me1P06801 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Me1P06801 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Me1P06801 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Me1P06801 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Me1P06801 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Me1P06801 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Me1P06801 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Me1P06801 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Me1P06801 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Me1P06801 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Me1P06801 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Me1P06801 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Me1P06801 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Me1P06801 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Me1P06801 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Me1P06801 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Me1P06801 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Me1P06801 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Me1P06801 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Me1P06801 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Me1P06801 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Me1P06801 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Me1P06801 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Me1P06801 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Me1P06801 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Me1P06801 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Me1P06801 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Me1P06801 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Me1P06801 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Me1P06801 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Me1P06801 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Me1P06801 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Me1P06801 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Me1P06801 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Me1P06801 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Me1P06801 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Me1P06801 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Me1P06801 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Me1P06801 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Me1P06801 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Me1P06801 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Me1P06801 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Me1P06801 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Me1P06801 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Me1P06801 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Me1P06801 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Me1P06801 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Me1P06801 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Me1P06801 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Me1P06801 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Me1P06801 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Me1P06801 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Me1P06801 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Me1P06801 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Me1P06801 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Me1P06801 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Me1P06801 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Me1P06801 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms