Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apoa4P06728 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apoa4P06728 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms