Protein–RNA interactions for Protein: P06324

T-cell receptor gamma chain V region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06324 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06324 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06324 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06324 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06324 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06324 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06324 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06324 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06324 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06324 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06324 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06324 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06324 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06324 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06324 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06324 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06324 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
P06324 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06324 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
P06324 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06324 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06324 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06324 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06324 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06324 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06324 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06324 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P06324 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P06324 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P06324 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P06324 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P06324 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P06324 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P06324 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P06324 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P06324 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P06324 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P06324 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P06324 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P06324 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P06324 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P06324 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06324 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06324 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06324 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P06324 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06324 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06324 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06324 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06324 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06324 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06324 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06324 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06324 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P06324 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06324 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06324 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06324 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06324 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06324 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06324 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06324 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06324 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06324 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06324 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06324 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06324 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06324 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06324 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06324 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06324 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06324 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06324 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06324 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06324 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06324 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06324 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06324 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06324 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06324 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06324 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06324 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06324 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P06324 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06324 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06324 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06324 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06324 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06324 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06324 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06324 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06324 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06324 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06324 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06324 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06324 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06324 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06324 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06324 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06324 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms