Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ItgamP05555 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ItgamP05555 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ItgamP05555 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ItgamP05555 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ItgamP05555 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ItgamP05555 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ItgamP05555 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ItgamP05555 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ItgamP05555 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ItgamP05555 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ItgamP05555 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ItgamP05555 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ItgamP05555 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ItgamP05555 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ItgamP05555 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ItgamP05555 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ItgamP05555 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ItgamP05555 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ItgamP05555 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ItgamP05555 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ItgamP05555 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ItgamP05555 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ItgamP05555 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ItgamP05555 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ItgamP05555 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgamP05555 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgamP05555 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgamP05555 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgamP05555 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ItgamP05555 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms