Protein–RNA interactions for Protein: P05524

Fgf3, Fibroblast growth factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf3P05524 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fgf3P05524 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf3P05524 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf3P05524 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fgf3P05524 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms