Protein–RNA interactions for Protein: P02463

Col4a1, Collagen alpha-1(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a1P02463 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col4a1P02463 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col4a1P02463 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms