Protein–RNA interactions for Protein: P01820

Ig heavy chain V region PJ14, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01820 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01820 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01820 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01820 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01820 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01820 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01820 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01820 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01820 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01820 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01820 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01820 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01820 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01820 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01820 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01820 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01820 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01820 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01820 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01820 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01820 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01820 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01820 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01820 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01820 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01820 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01820 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01820 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01820 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01820 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01820 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01820 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01820 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01820 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01820 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01820 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01820 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01820 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01820 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01820 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01820 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01820 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01820 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01820 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01820 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01820 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01820 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01820 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01820 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01820 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01820 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01820 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01820 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01820 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01820 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01820 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01820 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01820 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01820 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01820 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01820 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01820 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01820 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01820 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01820 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01820 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01820 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01820 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01820 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01820 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01820 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01820 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01820 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01820 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01820 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01820 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01820 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01820 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01820 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01820 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01820 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01820 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01820 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01820 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01820 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01820 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01820 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01820 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01820 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01820 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01820 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01820 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01820 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01820 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01820 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01820 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01820 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01820 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01820 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01820 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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