Protein–RNA interactions for Protein: P01796

Ig heavy chain V-III region A4, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01796 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01796 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01796 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01796 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01796 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01796 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01796 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01796 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01796 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01796 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01796 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01796 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01796 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01796 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01796 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01796 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01796 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01796 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01796 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01796 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01796 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01796 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01796 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01796 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01796 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01796 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01796 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01796 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01796 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01796 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01796 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01796 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01796 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01796 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01796 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01796 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01796 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01796 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01796 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01796 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01796 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01796 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01796 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01796 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01796 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01796 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01796 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01796 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01796 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01796 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01796 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01796 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01796 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01796 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01796 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01796 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01796 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01796 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01796 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01796 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01796 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01796 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01796 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01796 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01796 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01796 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01796 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01796 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01796 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01796 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01796 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01796 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01796 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01796 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01796 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01796 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01796 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01796 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01796 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01796 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01796 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01796 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01796 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01796 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01796 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01796 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01796 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01796 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01796 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01796 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01796 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01796 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01796 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01796 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01796 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01796 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01796 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01796 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01796 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01796 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms