Protein–RNA interactions for Protein: P01787

Ig heavy chain V regions TEPC 15/S107/HPCM1/HPCM2/HPCM3, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01787 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01787 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01787 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01787 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01787 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01787 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01787 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01787 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01787 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01787 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01787 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01787 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01787 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01787 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01787 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01787 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01787 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01787 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01787 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01787 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01787 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P01787 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01787 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01787 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01787 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01787 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01787 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01787 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01787 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01787 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01787 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01787 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01787 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01787 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01787 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01787 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01787 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01787 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01787 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01787 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01787 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
P01787 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01787 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01787 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01787 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01787 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01787 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01787 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01787 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01787 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01787 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01787 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01787 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01787 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01787 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01787 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01787 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01787 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01787 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01787 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01787 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01787 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01787 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01787 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01787 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01787 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01787 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01787 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01787 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01787 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01787 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01787 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01787 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01787 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01787 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01787 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01787 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01787 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01787 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01787 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01787 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01787 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01787 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01787 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01787 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01787 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01787 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01787 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01787 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01787 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01787 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01787 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01787 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01787 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01787 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01787 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01787 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01787 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01787 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01787 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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