Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01734 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
P01734 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01734 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01734 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
P01734 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01734 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
P01734 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01734 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01734 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01734 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
P01734 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01734 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01734 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01734 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01734 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01734 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01734 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01734 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01734 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01734 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01734 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01734 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01734 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01734 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01734 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01734 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01734 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01734 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01734 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01734 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01734 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01734 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01734 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01734 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01734 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01734 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01734 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01734 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01734 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01734 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01734 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01734 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01734 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
P01734 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01734 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01734 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01734 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01734 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01734 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01734 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01734 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01734 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01734 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01734 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01734 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01734 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01734 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
P01734 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01734 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01734 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01734 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
P01734 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01734 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01734 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01734 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01734 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01734 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01734 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01734 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01734 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01734 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01734 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01734 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01734 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01734 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01734 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01734 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01734 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01734 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01734 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01734 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01734 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01734 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01734 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01734 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01734 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01734 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01734 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01734 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01734 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01734 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01734 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01734 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01734 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01734 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01734 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01734 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01734 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01734 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms