Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01649 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01649 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01649 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01649 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01649 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01649 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01649 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01649 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01649 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01649 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01649 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01649 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01649 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01649 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01649 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01649 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01649 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01649 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01649 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01649 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01649 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01649 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01649 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01649 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01649 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01649 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01649 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01649 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01649 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01649 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01649 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01649 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01649 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01649 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01649 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01649 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01649 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01649 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01649 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01649 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01649 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01649 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01649 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01649 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01649 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P01649 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01649 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P01649 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01649 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01649 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01649 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01649 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01649 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01649 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P01649 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01649 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01649 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01649 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01649 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01649 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01649 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P01649 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01649 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01649 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01649 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01649 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01649 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01649 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01649 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P01649 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01649 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01649 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01649 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01649 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01649 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01649 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01649 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01649 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01649 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01649 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01649 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01649 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01649 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01649 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
P01649 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01649 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01649 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01649 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01649 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01649 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01649 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01649 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01649 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01649 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01649 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01649 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01649 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01649 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01649 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms