Protein–RNA interactions for Protein: P01643

Ig kappa chain V-V region MOPC 173, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01643 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01643 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01643 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01643 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01643 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01643 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01643 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01643 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P01643 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P01643 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01643 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01643 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01643 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01643 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01643 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01643 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01643 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01643 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01643 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01643 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01643 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01643 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01643 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01643 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P01643 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P01643 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01643 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01643 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01643 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P01643 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01643 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01643 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01643 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01643 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01643 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01643 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01643 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01643 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01643 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01643 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01643 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01643 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01643 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01643 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01643 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01643 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01643 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01643 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01643 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01643 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01643 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01643 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01643 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01643 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01643 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01643 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01643 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01643 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P01643 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P01643 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01643 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01643 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01643 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01643 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01643 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
P01643 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01643 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01643 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01643 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01643 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01643 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01643 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01643 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01643 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01643 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01643 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01643 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01643 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01643 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01643 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01643 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01643 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01643 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01643 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01643 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01643 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01643 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01643 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01643 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01643 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01643 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01643 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01643 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01643 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01643 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01643 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01643 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01643 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01643 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01643 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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