Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C4bP01029 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C4bP01029 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C4bP01029 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C4bP01029 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C4bP01029 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C4bP01029 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C4bP01029 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C4bP01029 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C4bP01029 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4bP01029 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4bP01029 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4bP01029 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4bP01029 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4bP01029 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4bP01029 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4bP01029 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4bP01029 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4bP01029 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4bP01029 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4bP01029 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4bP01029 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4bP01029 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4bP01029 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4bP01029 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4bP01029 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4bP01029 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4bP01029 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4bP01029 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4bP01029 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4bP01029 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4bP01029 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4bP01029 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C4bP01029 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4bP01029 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4bP01029 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4bP01029 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4bP01029 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4bP01029 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4bP01029 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4bP01029 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4bP01029 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4bP01029 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C4bP01029 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4bP01029 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4bP01029 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4bP01029 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4bP01029 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4bP01029 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4bP01029 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4bP01029 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4bP01029 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C4bP01029 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4bP01029 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4bP01029 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4bP01029 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4bP01029 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4bP01029 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4bP01029 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4bP01029 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C4bP01029 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C4bP01029 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4bP01029 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4bP01029 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4bP01029 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4bP01029 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4bP01029 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4bP01029 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4bP01029 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4bP01029 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4bP01029 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4bP01029 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4bP01029 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4bP01029 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4bP01029 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C4bP01029 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4bP01029 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4bP01029 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
C4bP01029 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4bP01029 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4bP01029 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4bP01029 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C4bP01029 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4bP01029 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4bP01029 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4bP01029 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4bP01029 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4bP01029 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4bP01029 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4bP01029 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4bP01029 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4bP01029 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C4bP01029 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4bP01029 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C4bP01029 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C4bP01029 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4bP01029 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4bP01029 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4bP01029 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4bP01029 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms