Protein–RNA interactions for Protein: P00520

Abl1, Tyrosine-protein kinase ABL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abl1P00520 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abl1P00520 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Abl1P00520 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Abl1P00520 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Abl1P00520 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abl1P00520 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abl1P00520 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abl1P00520 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abl1P00520 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Abl1P00520 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abl1P00520 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abl1P00520 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Abl1P00520 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Abl1P00520 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms