Protein–RNA interactions for Protein: O89001

Cpd, Carboxypeptidase D, mousemouse

Predictions only

Length 1,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpdO89001 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CpdO89001 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CpdO89001 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CpdO89001 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CpdO89001 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CpdO89001 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CpdO89001 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CpdO89001 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CpdO89001 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CpdO89001 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CpdO89001 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CpdO89001 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CpdO89001 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CpdO89001 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CpdO89001 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CpdO89001 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CpdO89001 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CpdO89001 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CpdO89001 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CpdO89001 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CpdO89001 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CpdO89001 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CpdO89001 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CpdO89001 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CpdO89001 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CpdO89001 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CpdO89001 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CpdO89001 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CpdO89001 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CpdO89001 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CpdO89001 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CpdO89001 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CpdO89001 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CpdO89001 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CpdO89001 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CpdO89001 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CpdO89001 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CpdO89001 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CpdO89001 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CpdO89001 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CpdO89001 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CpdO89001 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CpdO89001 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CpdO89001 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CpdO89001 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CpdO89001 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CpdO89001 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CpdO89001 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CpdO89001 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CpdO89001 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CpdO89001 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CpdO89001 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CpdO89001 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CpdO89001 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CpdO89001 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CpdO89001 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CpdO89001 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CpdO89001 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CpdO89001 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CpdO89001 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CpdO89001 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CpdO89001 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CpdO89001 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CpdO89001 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CpdO89001 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CpdO89001 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CpdO89001 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CpdO89001 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CpdO89001 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CpdO89001 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CpdO89001 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CpdO89001 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CpdO89001 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CpdO89001 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CpdO89001 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CpdO89001 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CpdO89001 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CpdO89001 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CpdO89001 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CpdO89001 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CpdO89001 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CpdO89001 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CpdO89001 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CpdO89001 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CpdO89001 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CpdO89001 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CpdO89001 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CpdO89001 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CpdO89001 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CpdO89001 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CpdO89001 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CpdO89001 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CpdO89001 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CpdO89001 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CpdO89001 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CpdO89001 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CpdO89001 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CpdO89001 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CpdO89001 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CpdO89001 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms