Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MscO88940 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MscO88940 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MscO88940 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MscO88940 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MscO88940 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MscO88940 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MscO88940 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MscO88940 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MscO88940 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MscO88940 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MscO88940 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MscO88940 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MscO88940 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MscO88940 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MscO88940 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MscO88940 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MscO88940 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MscO88940 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MscO88940 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MscO88940 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MscO88940 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MscO88940 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MscO88940 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MscO88940 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MscO88940 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MscO88940 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MscO88940 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MscO88940 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MscO88940 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MscO88940 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MscO88940 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MscO88940 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MscO88940 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MscO88940 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MscO88940 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MscO88940 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MscO88940 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MscO88940 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MscO88940 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MscO88940 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MscO88940 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MscO88940 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MscO88940 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MscO88940 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MscO88940 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MscO88940 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MscO88940 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MscO88940 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MscO88940 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MscO88940 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MscO88940 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MscO88940 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MscO88940 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MscO88940 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MscO88940 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MscO88940 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MscO88940 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MscO88940 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MscO88940 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MscO88940 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MscO88940 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MscO88940 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MscO88940 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MscO88940 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MscO88940 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MscO88940 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MscO88940 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MscO88940 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MscO88940 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MscO88940 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MscO88940 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MscO88940 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MscO88940 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MscO88940 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MscO88940 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MscO88940 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MscO88940 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MscO88940 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MscO88940 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MscO88940 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MscO88940 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MscO88940 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MscO88940 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MscO88940 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MscO88940 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MscO88940 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MscO88940 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MscO88940 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MscO88940 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MscO88940 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MscO88940 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MscO88940 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MscO88940 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MscO88940 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MscO88940 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MscO88940 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MscO88940 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MscO88940 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MscO88940 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms