Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apaf1O88879 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Apaf1O88879 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms