Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BlmO88700 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BlmO88700 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BlmO88700 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BlmO88700 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BlmO88700 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
BlmO88700 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BlmO88700 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
BlmO88700 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BlmO88700 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BlmO88700 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BlmO88700 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BlmO88700 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BlmO88700 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BlmO88700 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BlmO88700 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BlmO88700 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BlmO88700 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BlmO88700 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BlmO88700 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BlmO88700 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BlmO88700 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BlmO88700 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BlmO88700 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
BlmO88700 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BlmO88700 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BlmO88700 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BlmO88700 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BlmO88700 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BlmO88700 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BlmO88700 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BlmO88700 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BlmO88700 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BlmO88700 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BlmO88700 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BlmO88700 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BlmO88700 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BlmO88700 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BlmO88700 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BlmO88700 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BlmO88700 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BlmO88700 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BlmO88700 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BlmO88700 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
BlmO88700 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BlmO88700 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BlmO88700 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BlmO88700 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
BlmO88700 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BlmO88700 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BlmO88700 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BlmO88700 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
BlmO88700 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
BlmO88700 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
BlmO88700 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BlmO88700 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BlmO88700 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BlmO88700 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BlmO88700 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BlmO88700 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BlmO88700 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BlmO88700 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BlmO88700 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BlmO88700 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BlmO88700 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BlmO88700 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
BlmO88700 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
BlmO88700 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
BlmO88700 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
BlmO88700 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BlmO88700 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BlmO88700 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
BlmO88700 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BlmO88700 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BlmO88700 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BlmO88700 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BlmO88700 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BlmO88700 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BlmO88700 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BlmO88700 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BlmO88700 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BlmO88700 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BlmO88700 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BlmO88700 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BlmO88700 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BlmO88700 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
BlmO88700 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
BlmO88700 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
BlmO88700 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BlmO88700 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BlmO88700 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BlmO88700 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BlmO88700 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BlmO88700 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BlmO88700 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BlmO88700 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BlmO88700 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BlmO88700 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
BlmO88700 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BlmO88700 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms