Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtssO70370 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtssO70370 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CtssO70370 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtssO70370 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtssO70370 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtssO70370 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CtssO70370 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtssO70370 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtssO70370 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtssO70370 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtssO70370 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CtssO70370 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CtssO70370 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtssO70370 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtssO70370 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtssO70370 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtssO70370 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtssO70370 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtssO70370 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtssO70370 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtssO70370 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtssO70370 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtssO70370 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtssO70370 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtssO70370 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CtssO70370 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtssO70370 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CtssO70370 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CtssO70370 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtssO70370 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtssO70370 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtssO70370 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtssO70370 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtssO70370 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtssO70370 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CtssO70370 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtssO70370 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CtssO70370 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtssO70370 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtssO70370 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CtssO70370 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtssO70370 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtssO70370 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtssO70370 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CtssO70370 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CtssO70370 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtssO70370 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtssO70370 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtssO70370 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtssO70370 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtssO70370 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtssO70370 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtssO70370 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtssO70370 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtssO70370 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtssO70370 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtssO70370 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtssO70370 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CtssO70370 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CtssO70370 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtssO70370 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtssO70370 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtssO70370 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtssO70370 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtssO70370 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtssO70370 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtssO70370 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtssO70370 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtssO70370 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtssO70370 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtssO70370 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtssO70370 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CtssO70370 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtssO70370 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtssO70370 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtssO70370 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtssO70370 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtssO70370 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtssO70370 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtssO70370 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtssO70370 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtssO70370 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtssO70370 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtssO70370 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CtssO70370 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtssO70370 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtssO70370 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtssO70370 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtssO70370 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtssO70370 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtssO70370 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtssO70370 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtssO70370 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CtssO70370 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtssO70370 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtssO70370 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtssO70370 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtssO70370 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CtssO70370 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms