Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlx3O55144 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlx3O55144 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.6 ms