Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cyp26a1O55127 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cyp26a1O55127 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cyp26a1O55127 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms