Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap2O55126 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap2O55126 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms