Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trappc3O55013 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc3O55013 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc3O55013 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms