Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rdh16O54909 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh16O54909 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh16O54909 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh16O54909 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rdh16O54909 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh16O54909 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh16O54909 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Rdh16O54909 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh16O54909 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh16O54909 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Rdh16O54909 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Rdh16O54909 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Rdh16O54909 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Rdh16O54909 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh16O54909 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Rdh16O54909 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms