Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Itgb3O54890 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Itgb3O54890 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms