Protein–RNA interactions for Protein: O54798

Brs3, Bombesin receptor subtype-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brs3O54798 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brs3O54798 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brs3O54798 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brs3O54798 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brs3O54798 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Brs3O54798 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brs3O54798 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brs3O54798 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Brs3O54798 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brs3O54798 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brs3O54798 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Brs3O54798 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brs3O54798 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Brs3O54798 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms