Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffbO54788 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffbO54788 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffbO54788 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffbO54788 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffbO54788 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffbO54788 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffbO54788 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffbO54788 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DffbO54788 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffbO54788 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffbO54788 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffbO54788 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffbO54788 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffbO54788 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffbO54788 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffbO54788 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffbO54788 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffbO54788 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffbO54788 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffbO54788 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffbO54788 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffbO54788 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DffbO54788 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DffbO54788 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DffbO54788 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DffbO54788 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DffbO54788 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DffbO54788 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DffbO54788 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DffbO54788 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DffbO54788 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DffbO54788 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DffbO54788 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffbO54788 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffbO54788 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffbO54788 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffbO54788 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffbO54788 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffbO54788 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffbO54788 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffbO54788 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffbO54788 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffbO54788 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffbO54788 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffbO54788 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffbO54788 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffbO54788 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DffbO54788 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffbO54788 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffbO54788 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffbO54788 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DffbO54788 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffbO54788 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffbO54788 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffbO54788 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DffbO54788 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DffbO54788 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffbO54788 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffbO54788 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffbO54788 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DffbO54788 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffbO54788 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffbO54788 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffbO54788 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffbO54788 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffbO54788 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffbO54788 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffbO54788 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffbO54788 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffbO54788 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffbO54788 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DffbO54788 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffbO54788 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffbO54788 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffbO54788 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffbO54788 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffbO54788 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffbO54788 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffbO54788 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffbO54788 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffbO54788 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffbO54788 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffbO54788 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffbO54788 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffbO54788 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffbO54788 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffbO54788 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffbO54788 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffbO54788 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffbO54788 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffbO54788 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DffbO54788 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffbO54788 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffbO54788 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffbO54788 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffbO54788 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffbO54788 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffbO54788 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DffbO54788 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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