Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccr6O54689 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccr6O54689 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms