Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cited2O35740 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cited2O35740 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cited2O35740 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cited2O35740 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cited2O35740 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cited2O35740 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cited2O35740 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cited2O35740 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cited2O35740 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cited2O35740 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cited2O35740 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cited2O35740 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cited2O35740 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cited2O35740 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cited2O35740 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cited2O35740 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cited2O35740 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cited2O35740 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cited2O35740 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cited2O35740 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cited2O35740 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cited2O35740 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cited2O35740 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cited2O35740 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cited2O35740 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cited2O35740 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cited2O35740 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cited2O35740 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cited2O35740 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cited2O35740 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cited2O35740 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cited2O35740 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cited2O35740 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cited2O35740 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cited2O35740 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cited2O35740 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cited2O35740 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cited2O35740 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cited2O35740 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cited2O35740 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cited2O35740 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cited2O35740 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cited2O35740 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cited2O35740 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cited2O35740 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cited2O35740 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cited2O35740 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cited2O35740 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cited2O35740 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cited2O35740 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cited2O35740 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cited2O35740 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cited2O35740 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cited2O35740 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cited2O35740 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cited2O35740 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cited2O35740 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cited2O35740 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cited2O35740 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cited2O35740 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cited2O35740 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cited2O35740 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cited2O35740 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cited2O35740 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cited2O35740 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cited2O35740 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cited2O35740 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Cited2O35740 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cited2O35740 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cited2O35740 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms