Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf9O35739 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf9O35739 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf9O35739 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf9O35739 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf9O35739 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf9O35739 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klf9O35739 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf9O35739 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf9O35739 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf9O35739 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf9O35739 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf9O35739 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf9O35739 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf9O35739 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf9O35739 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf9O35739 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf9O35739 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf9O35739 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Klf9O35739 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf9O35739 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf9O35739 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf9O35739 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf9O35739 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf9O35739 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf9O35739 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf9O35739 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf9O35739 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf9O35739 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf9O35739 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf9O35739 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf9O35739 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf9O35739 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klf9O35739 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Klf9O35739 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf9O35739 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Klf9O35739 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf9O35739 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf9O35739 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klf9O35739 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms