Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Tnfrsf18O35714 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Tnfrsf18O35714 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tnfrsf18O35714 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Tnfrsf18O35714 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Tnfrsf18O35714 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Tnfrsf18O35714 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Tnfrsf18O35714 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tnfrsf18O35714 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Tnfrsf18O35714 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms