Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppef2O35385 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppef2O35385 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms