Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih1O35372 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih1O35372 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih1O35372 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih1O35372 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih1O35372 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih1O35372 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih1O35372 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih1O35372 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih1O35372 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih1O35372 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih1O35372 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih1O35372 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih1O35372 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih1O35372 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih1O35372 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnih1O35372 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih1O35372 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih1O35372 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih1O35372 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih1O35372 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih1O35372 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih1O35372 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih1O35372 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih1O35372 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih1O35372 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih1O35372 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih1O35372 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih1O35372 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih1O35372 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih1O35372 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih1O35372 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih1O35372 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih1O35372 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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