Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nedd9O35177 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
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Nedd9O35177 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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Nedd9O35177 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Nedd9O35177 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
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Nedd9O35177 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Nedd9O35177 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nedd9O35177 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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