Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcns1O35173 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcns1O35173 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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