Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ArxO35085 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ArxO35085 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ArxO35085 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ArxO35085 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ArxO35085 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ArxO35085 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ArxO35085 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ArxO35085 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ArxO35085 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ArxO35085 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ArxO35085 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ArxO35085 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ArxO35085 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ArxO35085 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ArxO35085 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ArxO35085 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ArxO35085 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ArxO35085 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ArxO35085 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ArxO35085 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ArxO35085 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ArxO35085 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ArxO35085 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ArxO35085 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ArxO35085 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ArxO35085 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ArxO35085 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ArxO35085 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ArxO35085 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ArxO35085 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ArxO35085 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ArxO35085 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ArxO35085 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ArxO35085 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ArxO35085 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ArxO35085 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ArxO35085 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ArxO35085 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ArxO35085 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ArxO35085 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ArxO35085 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ArxO35085 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ArxO35085 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ArxO35085 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ArxO35085 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ArxO35085 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ArxO35085 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ArxO35085 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ArxO35085 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ArxO35085 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ArxO35085 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ArxO35085 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ArxO35085 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ArxO35085 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ArxO35085 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ArxO35085 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ArxO35085 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ArxO35085 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ArxO35085 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ArxO35085 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ArxO35085 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ArxO35085 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ArxO35085 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ArxO35085 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ArxO35085 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ArxO35085 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ArxO35085 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ArxO35085 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ArxO35085 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ArxO35085 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ArxO35085 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ArxO35085 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ArxO35085 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ArxO35085 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ArxO35085 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ArxO35085 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ArxO35085 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ArxO35085 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ArxO35085 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ArxO35085 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ArxO35085 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ArxO35085 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ArxO35085 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ArxO35085 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ArxO35085 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ArxO35085 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ArxO35085 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ArxO35085 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ArxO35085 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ArxO35085 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ArxO35085 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ArxO35085 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ArxO35085 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ArxO35085 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ArxO35085 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ArxO35085 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ArxO35085 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ArxO35085 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ArxO35085 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms