Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn4O35054 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn4O35054 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn4O35054 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn4O35054 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn4O35054 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn4O35054 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn4O35054 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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