Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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H2-Q1O19441 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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H2-Q1O19441 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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H2-Q1O19441 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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H2-Q1O19441 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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H2-Q1O19441 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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H2-Q1O19441 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2-Q1O19441 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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H2-Q1O19441 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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H2-Q1O19441 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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H2-Q1O19441 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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H2-Q1O19441 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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H2-Q1O19441 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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H2-Q1O19441 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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H2-Q1O19441 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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H2-Q1O19441 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-Q1O19441 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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