Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LhbO09108 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LhbO09108 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LhbO09108 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LhbO09108 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LhbO09108 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LhbO09108 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LhbO09108 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LhbO09108 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LhbO09108 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LhbO09108 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LhbO09108 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LhbO09108 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LhbO09108 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LhbO09108 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LhbO09108 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LhbO09108 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LhbO09108 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LhbO09108 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LhbO09108 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LhbO09108 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LhbO09108 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LhbO09108 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LhbO09108 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LhbO09108 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LhbO09108 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LhbO09108 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LhbO09108 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LhbO09108 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LhbO09108 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LhbO09108 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LhbO09108 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LhbO09108 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LhbO09108 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
LhbO09108 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LhbO09108 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LhbO09108 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LhbO09108 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LhbO09108 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LhbO09108 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LhbO09108 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LhbO09108 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LhbO09108 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LhbO09108 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LhbO09108 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LhbO09108 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LhbO09108 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LhbO09108 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LhbO09108 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LhbO09108 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LhbO09108 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LhbO09108 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LhbO09108 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LhbO09108 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LhbO09108 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LhbO09108 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LhbO09108 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LhbO09108 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LhbO09108 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LhbO09108 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LhbO09108 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LhbO09108 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LhbO09108 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LhbO09108 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LhbO09108 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LhbO09108 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LhbO09108 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LhbO09108 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LhbO09108 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LhbO09108 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LhbO09108 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LhbO09108 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LhbO09108 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LhbO09108 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LhbO09108 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LhbO09108 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LhbO09108 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LhbO09108 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LhbO09108 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LhbO09108 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LhbO09108 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LhbO09108 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LhbO09108 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LhbO09108 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LhbO09108 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LhbO09108 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LhbO09108 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LhbO09108 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LhbO09108 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LhbO09108 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LhbO09108 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LhbO09108 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LhbO09108 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LhbO09108 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LhbO09108 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LhbO09108 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LhbO09108 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LhbO09108 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LhbO09108 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LhbO09108 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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