Protein–RNA interactions for Protein: O08917

Flot1, Flotillin-1, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flot1O08917 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Flot1O08917 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Flot1O08917 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Flot1O08917 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Flot1O08917 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Flot1O08917 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Flot1O08917 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Flot1O08917 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Flot1O08917 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Flot1O08917 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms