Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Eftud2O08810 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Eftud2O08810 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms