Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nfil3O08750 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfil3O08750 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms