Protein–RNA interactions for Protein: O08739

Ampd3, AMP deaminase 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ampd3O08739 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ampd3O08739 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ampd3O08739 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ampd3O08739 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ampd3O08739 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ampd3O08739 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ampd3O08739 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ampd3O08739 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ampd3O08739 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ampd3O08739 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ampd3O08739 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ampd3O08739 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ampd3O08739 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ampd3O08739 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ampd3O08739 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ampd3O08739 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ampd3O08739 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ampd3O08739 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ampd3O08739 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms